Comp Biol/Gene Editing

Machine Learning in Nonischemic Cardiomyopathy: Phenotyping, Mechanism Discovery, and Clinical Applications

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Quansah K, Anderson E, Kwon E, Kwon C

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Cardiology Review                                                                                                                        2026​

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Machine Learning Models Enhance Detection of Arrhythmogenic Right Ventricular Cardiomyopathy

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Quansah KK, Murphy SA, Kwon E, Anderson E, Tichnell C, Murray B, Gaines S, Gasperetti A, James CA, Calkins H, Carrick RT, Kwon C.

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Machine Learning: Health                                                                                                          2026                      ​​

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Establishment of a Homozygous LMNA Knock-out Human Induced Pluripotent Stem Cell Line using CRISPR/Cas9 System

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Park SH, Suh D, Kim H, Lee RR, Coscarella IL, Oh J, Kim S, Kim HP, Kwon C, Lee CJ, Park SW, Lee S

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Stem Cell Research                                                                                                                    2025                   

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Platform-Agnostic CellNet Enables Cross-Study Analysis of Cell Fate Engineering Protocols

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Lo EKW, Velazquez JJ, Peng D, Kwon C, Ebrahimkhani MR, Cahan P.

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Stem Cell Reports                                                                                                                        2023  

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Trajectory Reconstruction Identifies Dysregulation of Perinatal Maturation Programs in Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes

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Kannan S, Miyamoto M, Zhu R, Lynott M, Guo J, Chen EZ, Colas AR, Lin BL, Kwon C

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Cell Reports                                                                                                                                  2023 

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Cross-Organ Transcriptomic Comparison Reveals Universal Factors during Maturation

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Kambhampati S, Murphy S, Uosaki H, Kwon C

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Journal of Computational Biology                                                                                              2022 

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Transcriptomic Entropy Benchmarks Stem Cell-Derived Cardiomyocyte Maturation against Endogenous Tissue at Single Cell Level

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Kannan S, Farid M, Lin BL, Miyamoto M, Kwon C

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PLoS Computational Biology                                                                                                       2021

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PGC1/PPAR Drive Cardiomyocyte Maturation at Single Cell Level via YAP1 and SF3B2

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Murphy SA, Miyamoto M, Kervadec A, Kannan S, Tampakakis E, Kambhampati S, Lin BL, Paek S, Andersen P, Lee DI, Zhu R, An SS, Kass DA, Uosaki H, Colas AR, Kwon C

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Nature Communications                                                                                                              2021

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Complete Guide RNA Design for CRISPR-Mediated Regulation of Human Long Noncoding RNA Transcription

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Saberi A, Zhu R, Kwon C

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bioRxiv                                                                                                                                           2018

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Transcriptional Landscape of Cardiomyocyte Maturation

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Uosaki H, Cahan P, Lee DI, Wang S, Miyamoto M, Fernandez L, Kass DA, Kwon C

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Cell Reports                                                                                                                                   2015

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